很多患者在做牙齒矯正前，都會擔心如果做牙齒矯正會不會有危害，其實牙齒矯正的關鍵在于前期設計，對于患者需要拔牙矯正，盡量不要采用片切牙體的方式，這樣可以防止反彈。當然，醫生在術中用力的時候，一定要采用平緩的力度，否則就會出現骨質瘢痕性修復，給后來的牙周炎出現，帶來了隱患。牙齒矯正是常規治療，需要醫生注意的是，工作仔細，將手術后的注意事項給患者講清楚，手術后一定要長期佩戴保持器，但是也會有一定的壞處。
松動的牙齒正畸治療的情況是更典型的危險，因為在正常情況下，每個牙有一定的物理流動咀嚼緩沖壓力，防止牙齒創傷。在矯正治療，牙齒松動度增加，這是正常的反應。牙齒移動，需要牙槽骨和牙周膜的重建，因為牙齒固定在在牙周膜，這將松動的牙齒。但牙齒矯正到正常位置后停止運動，牙齒修復牙周膜連接可以通過自己的能力又成為固體，不會發生永久性的損害。
影響牙根這是更常見的口腔正畸損害，這是因為在正畸治療中，根表面吸收，增生的重建活動。治療后，根能夠修復和恢復正常，但如果治療強度太大，會增加牙根的風險
對牙槽骨高度會有影響，它是一個潛在的風險等。在矯正治療，會有少量的牙槽骨高度降低，這是由于磨損和校正裝置使口腔衛生不容易維護，增加牙齦炎的機會，對牙槽骨有一定的影響，牙齒矯正治療，牙槽骨完成后將不再繼續吸收，如果口腔衛生保持良好，牙槽骨會逐漸恢復正常。
同時對牙髓也會有的影響，在早期矯正治療牙齒，牙髓內產生輕微和暫時的炎癥，表現為患者在最初幾天的強度在疼痛或不適，但實驗表明，這種危險的正畸治療是沒有臨床意義的。