反常性痤瘡是指在某個患者身上同時發生聚合性痤瘡、化膿性汗腺炎和頭部膿腫性穿鑿性毛囊周圍炎。反常性痤瘡的確切病因及發病機制尚不十分清楚，目前認為是由毛囊閉鎖、遺傳因素、激術水平變化及外因刺激等多種因素共同作用引起發病。
（1）毛囊閉鎖：本病的主要病因為毛囊閉鎖，其發生可能與毛囊結構及功能方而的遺傳學異常有關。毛囊皮脂腺導管角化過度，導管口徑變小、狹窄、阻塞或閉鎖，則影響毛囊壁脫落的上皮細胞和皮脂的正常排出、使得毛囊內容物潴留，招致微生物感染，并引發深部毛囊炎或毛囊周圍炎，形成膿腫、竇道及瘢痕。
（2）遺傳因索：臨床上發現患者往往有家族史。經調查研究表明，本病可能是染色體先行的單基因遺傳病，但致病基因的定位尚未明確。
（3）細菌感染：細菌感染是繼發性的，雖然在患者皮損中可培養到金黃色葡萄球菌、白色葡萄球菌、鏈球菌或雙球菌、大腸埃希菌及銅綠假單胞菌等，但檢出的細菌株復雜不穩定，常歲發病部位的不同而有所變化，且細菌培養陰性者不在少數。
（4）免疫因素：本病可與壞疽性膿皮病、Crohn病等免疫性疾病并發。病情活動時讓往往有血沉加快、外周血白細胞總數及功能改變、蛋白電泳圖譜改變等。組織病理有肉芽腫樣反應，抗生素治療效果欠佳，而糖皮質激素及環孢素等免疫抑制劑治療有效，提示免疫因素在本病發病中起重要作用。
（5）其他因素：反常性痤瘡多于青春期前后初發，患者大多為油性皮膚。男性患者絕經后病情明顯減輕，甚至完全消退，提示性激素水平與發病有關。