唇、腭裂修復手術的時間各個醫院有所不同，我院唇腭裂中心提倡唇裂在2個月以后，腭裂在18個月以前實行手術。 對同時患有唇、腭裂的小兒，一般分兩次手術，腭裂在唇裂修復術后3-6個月進行。
若家長要求迫切，剛出生的患兒也可以進行唇裂修復術，但效果并不比2個月后進行手術者優越，而手術和麻醉的風險以及護理的困難要大一些。不論唇裂或腭裂，在等待手術期間，家長要保證患兒的營養和正常發育，避免呼吸道感染，以使患兒在全身健康狀態下接受手術。
若新生兒的裂隙很寬，或雙側唇裂者前頜高聳，家長最好盡早與醫院聯系，醫生可根據情況給予必要的指導或提前采取一定的措施以利手術的進行。
手術前醫生會向患兒家長說明手術的有關問題，包括手術和麻醉的方式、可能的危險和并發癥、注意事項以及大概的費用等。
唇裂手術的原則是在裂口兩側切開，延長白唇轉移紅唇。按照設計的標志點，將兩側肌肉、皮膚和紅唇對位縫合達到正常的形態。術后早期切口會有些發紅，一般在半年后逐漸消退。在此期間可以外用一些藥物以抑制瘢痕增生。
腭裂手術時醫生在上腭的兩側作切口，游離后將軟組織向中間推移，分層縫合兩側的肌肉、粘膜和粘骨膜而重建上腭。腭裂手術的創傷比唇裂大，手術后疼痛和不適會影響患兒進食，應設法補充高營養的流質，必要時給予靜脈補液。具體內容請您參考
首次唇、腭裂修復后還可能遺留一些問題，例如切口的瘢痕增生、鼻翼和鼻小柱畸形等，這些可在學齡前作進一步處理。為更好地提高腭裂患兒的語言功能，手術后2-3個月可開始進行語言訓練。我院語言訓練室專門從事這方面的工作。
若因牙槽嵴裂隙發生牙齒扭曲或牙列不齊，可在5-6歲后進行牙齒正畸治療。為了修復牙槽嵴裂隙，使分離的上頜骨愈合在一起，最好的辦法是進行牙槽嵴植骨手術。
牙槽嵴裂植骨修復術是唇腭裂序列治療的一部分， 一般在7歲后進行。手術時自唇側和腭側掀起牙齦組織瓣，嚴密縫合形成植骨腔隙，取自體松質骨植入其中。通過牙槽嵴植骨術可以恢復前頜骨的穩定和牙弓的完整，誘導異位的牙胚萌出并長入缺牙間隙。