剖腹產是分娩的一種方式，雖然它挽救了很多母子的生命，但是也是需要知道，這也是一種無奈的選擇。如果能夠采取順產的方式，才是最好的，因為分娩方式對嬰兒、對孕婦都有著很大的危害。剖腹產的危害主要表現在以下幾個方面：
容易造成陰道萎縮
剖腹產婦女絕經后陰道萎縮情況比自然分娩的婦女嚴重，對性生活有一定影響，很多發達國家的人們重視中老年性生活，因此在年輕時便注意避免剖宮產。
容易造成子宮出血
剖腹產可令子宮收縮乏力發生率增加，從而造成術后出血增多。
容易出現羊水栓塞
手術中羊水可能進入血液循環，引發嚴重的過敏反應及栓塞，極其兇險。雖然現在的剖宮產會在操作中通過壓住血管后讓羊水排凈的做法將這種風險降到最低，但羊水栓塞的嚴重后果仍讓產科醫生不得不保持高度警惕。
容易感染粘連
手術增加了感染機會，手術切口感染、子宮內膜炎、泌尿道感染是常見的三種術后感染。由于手術對人體的損傷，術后容易造成盆腔粘連，埋下腸道蠕動減少甚至梗阻等隱患。
有麻醉并發癥
剖宮產需要麻醉，也存在一定的風險，此外，手術過程會損傷神經，造成術后長期隱隱痛。還可能損傷產婦的膀胱、輸尿管和腸道；少數情況還會出現切口疝（內臟如腸子等從切口突出來）。
胎兒容易誤吸羊水
胎兒在子宮內有吞服羊水的生理現象，但抗胃食管反流結構沒有發育成熟，嬰兒在剖宮產中沒有受到產道的擠壓把上消化道的羊水擠干凈，在取出母體后的3-5分鐘時，約有0.7%的嬰兒會誤吸羊水到肺部，引起嚴重的肺炎甚至窒息。盡管用手托法等措施可以防止這個并發癥，但風險難以100%避免。
情商受損
在新生兒的神經-行為評分中，剖宮產兒在第7天和第14天得分均低于陰道分娩兒。在遠期，國外研究證實剖宮產兒的情商（EQ）會比較低，其可能的原因是剖宮產兒沒有經過產道對大腦顳葉的擠壓刺激，而顳葉是與情緒相關的神經中樞。剖宮兒與人交流的能力相對較弱，在幼年容易出現孤獨癥，現在大學生中很多情感、自殺的問題也許跟剖宮產有關。
對胎兒不利
剖宮產中的手術器械和操作還容易造成嬰兒皮膚劃傷和骨折，根據人工推算的手術日期還可能與實際孕齡不符，造成人為的早產。