引起乳頭凹陷的原因可分為先天性的和后天行的。
先天性乳頭凹陷的具體原因是：
1、乳頭和乳暈的平滑肌發育不良：乳頭有輸乳管的開口、輸乳管周圍有平滑肌纖維，內陷的乳頭被圍繞輸乳管和插入乳頭真皮的肌纖維束向內牽拉。這些肌束的質地與輸乳管有明顯差別。
2、輸乳管本身發育不全：發育不全的輸乳管未能導管化表現為條索。
3、乳頭下缺乏支撐組織的撐托，也是乳頭內陷的原因。
后天性乳頭凹陷的具體原因有：
1、衣著過于緊束。特別是女性在胸部發育期內衣過緊，很容易導致乳頭凹陷。
2、乳罩使用不當。乳罩過小、過緊，使用過早，都會引起乳頭凹陷。
3、乳頭凹陷與遺傳也有一定關系，臨床觀察母親及其母親一代人中、姥姥有乳頭凹陷史者，下一代罹患乳頭凹陷的可能比正常人要高。
乳頭凹陷主要是先天性的，但也可由外傷或手術、乳腺腫瘤以及乳腺炎后的纖維增生引起。
1、乳頭和乳暈的平滑肌發育不良：乳頭有輸乳管的開口、輸乳管周圍有平滑肌纖維，內陷的乳頭被圍繞輸乳管和插入乳頭真皮的肌纖維束向內牽拉。這些肌束的質地與輸乳管有明顯差別。
2、輸乳管本身發育不全：發育不全的輸乳管未能導管化表現為條索。
3、乳頭下缺乏支撐組織的撐托，也是乳頭內陷的原因。