太田痣臨床表現變化較大，輕者可以只表現為眼眶周圍的淡褐色的點狀或片狀色素斑，重的可表現為單側面部或雙側面部的褐色，青褐色或青黑色色素斑。病灶邊界不清，病灶內的斑點色澤可以單色，也可兼有上述顏色，而且色澤深淺不一。
1、根據色素的顏色、分布及累及等特點，可以作出此病的診斷。但需與蒙古斑、藍痣等鑒別。蒙古斑出生即有，能自然消退。且不波及到眼和粘膜。組織象中真皮內黑素細胞數量較少，位置較深。藍痣為藍黑色的丘疹或小結節，好發于手足背及面部、臀部，組織象中黑色素細胞聚集成團。
2、太田痣皮損一般為淡青色、灰藍色、褐青色至藍黑色或褐黃色的斑片或斑點，斑片中央色深，邊緣漸變淡，偶爾色素斑的某些區域可隆起甚至發生粟粒到綠豆大小的小結節。斑點呈群集狀分布，疏密不一，或中央為斑片，邊緣為斑點。
3、太田痣的顏色可有一定的變化，如夏季顏色較深，冬季較淺，情緒對顏色也有影響。皮損的顏色因日曬、勞累、月經期、妊娠而加重。有的青春期變深擴大。本病最常見的受累部位為眶周、顳、前額、顴部和鼻翼，即相當于三叉神經第、二支分布的區域；單側分布，偶為雙側性（約10%左右），約2/3的患者同側鞏膜出現藍染，結膜、角膜、虹膜、眼底、視神經乳頭、視神經、眼球后脂肪及眶周骨膜也可累及。