1、 生理機能失調主要是激素類藥物一直腎上腺皮質功能所致。其中最常見的有女性患者發生月經紊亂，主要表現在每次月經行 徑時間延長，經血量增多，或出現斷斷續續的假性月經。個別患者出現閉經，此時應即使停藥。激素累藥物的這類副作用是可逆的，一般停藥后1~2個月內月經會 完全恢復正常，個別患者需到婦科對癥處理。在停藥期間，應改用非激素類藥物繼續疤痕修復注射。
2、 局部組織壞死主要是單次注射的劑量過大所致。此外，還和注射時用的針頭過粗，皮下淤血未能及時壓迫止血， 注射時缺乏無菌觀念，個體對藥物的敏感度過高有關。
3、 皮下藥物顆粒沉積若注射的層次過淺，隨著疤痕的萎縮變薄會逐漸暴露出來，而形成索條狀或點狀的白色鈣化灶，影響局部美觀，次鈣化社會通過身體的排異反應逐漸清除，也可通過手術方式剔除。
4、 過敏反應個別患者注射藥物后局部發生紅斑、風團、瘙癢等反應，這大部分是由于使用普魯卡因作為局麻藥物所致。普魯卡因有致敏性，可改用利多卡因，并根據過敏程度口服或靜脈應用抗過敏藥。
5、 無效，個別患者注射藥物后疤痕無任何反應，一個療程結束后疤痕無任何萎縮軟化跡象，這時應繼續觀察1~2個月，仍無反應，說明該患者對該藥物不過敏，屬患者特異性體質所致，應改用其他藥物或其他療法疤痕修復。
6、 皮損擴大由于疤痕疙瘩內有大量可收縮的成纖維細胞，在疤痕形成過程中，此細胞的持續收縮使組織高度攣縮，創面縮小，疤痕內注射藥物后，此種細胞被破壞， 攣縮的力量消除，皮損軟化的同時就會擴大，目前尚無有效防治方法。
7、復發，由于疤痕疙瘩的發病機理尚不十分清楚，目前還缺乏十分理想的根除方法，治療后復發率高是疤痕疙瘩的一大特征，特別是青壯年患者復發率更高。