1、對牙髓的影響：在治療初期，牙髓內產生輕度的、暫時性的炎癥反應，表現為患者在加力的頭幾天內有疼痛或不適感，但實驗證明，這種影響是沒有臨床意義的。
2、對牙根的影響：牙齒矯正時，牙根表面也發生著吸收、增生這種重建活動。治療后，牙根憑著自身修復能力而恢復正常，但如果治療中加力過大，會增加牙根吸收的危險性。
3、對牙槽骨高度的影響：做過正畸治療的人，牙槽骨高度都會有少量的降低，這是由于戴矯治器使口腔衛生不易保持，增加患牙齦炎的機會，對牙槽骨有一定的影響，在治療完成后，牙槽骨不會再繼續發生吸收，如果口腔衛生保持好，牙槽骨會逐漸恢復正常。
4、牙齒變松動：在正常情況下，每個牙都有一定的生理動度以便能緩沖咀嚼壓力，防止牙齒受創傷。在做矯正治療時，牙齒松動度增加，這是正常反應。