1、肛管直腸結腸疾病：最多見為直腸腫瘤及炎癥性疾病，直腸腫瘤浸潤破壞括約肌，潰瘍性結腸炎，克隆病引起直腸炎癥長期腹瀉，完全性直腸脫垂引起肛門松弛，陰部神經牽拉受損等。
2、創傷主要是括約肌損傷：最多見的原因是肛管直腸部手術和產傷，尤其是高位肛瘺手術破壞肛管直腸和括約肌，產傷中第三度會陰撕裂。此外，內痔、肛裂、直腸脫垂琢直腸腫瘤等手術處理不當，或肛管部組織遭受外來暴力、藥物注射、灼傷、凍傷等均可引起肛門松弛。
3、神經系統疾病：如中樞神經系統疾病，脊柱裂，脊髓脊膜膨出，脊髓及骶神經損傷、感染和脊髓瘤。
4、先天因素：如先天無肛、無肛門括約肌、脊柱裂、脊髓脊膜膨出等常合并肛門松弛。
5、手術或外傷：在高位復雜性肛瘺手術中造成肛管直腸環損傷，因外傷破壞了肛門直腸環及肛門括約肌群得完整性造成的肛門括約肌完全或不完全的功能消失。
6、生育因素：婦女生育時的會陰撕裂傷使肛門前側括約肌完全斷裂造成肛門松弛。
7、肛周肌肉損傷：肛管直腸環、肛門括約肌和肛提肌等損傷，大多數是由于肛門直腸手術引起。如肛門直腸膿腫、肛瘺、肛門松弛、內外痔等手術時，不慎將其切斷，也有因肛門直腸周圍蜂窩組織炎、肛門部燒傷瘢痕形成或因藥物腐蝕造成損傷而致；也可由于肛門部外傷，如火器損傷、異物損傷、裂傷、撕傷等原因，而引起肛門松弛。