胎記一般不影響健康，但極少數胎記會合并身體器官的異常，甚至有惡變的可能。
位于臉頰與眼眶位置的葡萄酒色痣：常伴隨有青光眼等視覺器官疾病，或與癲癇有關。另外，此類痣斑與斯-韋綜合征（一種腦部三叉神經血管瘤，可致發育遲緩），或有一定關聯。
血管瘤：體積比較大的血管瘤，會妨礙某些器官的正常工作，影響其正常生理機能。比如，血管瘤生于食道附近，則會影響進食；生于眼球附近，則影響視力；生長在呼吸系統，則會妨礙呼吸。
脊椎下部的胎記：有向皮膚深部蔓延之可能，會危害到正常的血液循環和神經系統的工作。
咖啡牛乳色斑群：身體上有多個咖啡牛乳色斑，患有神經纖維瘤的可能性比較大。這類患兒隨著年時間的推移，斑塊會變得越來越多。可怕的是，大約半數的該病患者會出現學習能力障礙。
癌變風險：大塊的斑塊，尤其是與生俱來的，極有可能誘發癌癥。