陰囊濕疹的診斷并不困難。根據皮損的特點和劇烈瘙癢的情況一般即可以作出診斷。有時需要與陰囊的神經性皮炎、核黃素缺乏引起的陰囊瘙癢及乳房外濕疹樣癌作出鑒別。
（1）陰囊神經性皮炎
可見連成片的扁平丘疹，嚴重者遍布整個陰囊。其特點是，雖有瘙癢，但無滲液，日久皮膚變厚，呈席紋狀。
（2）核黃素缺乏引起的陰囊瘙癢
病程一般較短，一般無明顯的皮膚肥厚，內服核黃素可在短期內見效。常常伴有舌炎或口角炎。
（3）乳房外濕疹樣癌
本病又稱Paget's disease（帕哲氏病），外觀類似濕疹，但仔細觀測，皮損為境界清楚的紅色斑片，表面有滲出結痂和角化鱗屑，逐漸擴大，甚至出現潰瘍。需要作組織病理檢查以明確診斷。